중도퇴사 연말정산, 6월에 그만두면 왜 세금을 돌려받을까?

월급 300만 원(식대 20만 원 포함)을 받던 직장인이 2026년 6월 30일에 회사를 그만둡니다. 마지막 급여에서 회사가 상반기 소득만으로 연말정산을 하고, 매달 뗀 소득세 34만 800원 가운데 약 28만 9천 원을 돌려줍니다. 지방소득세까지 합치면 약 31만 8천 원이에요.

2026년 10월 2일 기준 · 소득세법 제137조(근로소득세액의 연말정산)·제73조, 시행령 [별표 2] 근로소득 간이세액표(2026. 2. 27. 개정) · 2026년 귀속 계산

이 사람이 9월에 다른 회사에 들어가면 이야기가 달라져요. 새 회사에 전 직장 서류를 내지 않고 따로 정산받으면, 2027년 2월에 41만 원을 돌려받은 뒤 5월에 43만 원을 다시 내야 합니다. 환급이 컸던 만큼 되돌려 낼 돈도 큽니다.

퇴사하는 달에 회사가 하는 중도퇴사 연말정산

소득세법은 회사가 퇴직하는 달의 급여를 줄 때 그해 1월부터 퇴사일까지의 소득으로 연말정산을 하도록 정해 두었습니다. 계속 다니는 직원이 이듬해 2월에 받는 정산을 퇴사 시점에 앞당겨 하는 셈이에요.

환급이 생기는 이유는 매달 떼는 세금의 기준에 있어요. 근로소득 간이세액표는 그 월급을 1년 내내 받는다고 보고 세금을 떼는데, 6개월만 일하면 총급여가 1,680만 원에 그쳐 적용되는 세율과 공제가 달라집니다.

퇴사 달 정산(1~6월 근무)	금액
총급여(비과세 식대 제외 280만 원 × 6개월)	1,680만 원
근로소득공제	−777만 원
본인 기본공제 + 국민연금 보험료	−229만 8천 원
과세표준	673만 2천 원
산출세액(6%)	403,920원
근로소득세액공제	−222,156원
표준세액공제	−130,000원
결정세액	51,764원
이미 뗀 소득세(56,800원 × 6개월)	340,800원
돌려받는 소득세	289,036원

퇴사할 때는 대개 1월 간소화 자료가 없어서 부양가족이나 카드, 의료비 공제가 빠진 채로 정산되는데, 빠진 공제는 나중에 다시 챙길 수 있어요.

재취업했다면 갈리는 세 가지 길

같은 사람이 9월부터 12월까지 새 회사에서 월급 350만 원(과세 330만 원)을 받았다고 해 볼게요. 새 회사도 간이세액표대로 넉 달 동안 소득세 41만 1,080원을 뗍니다. 이후의 정산은 전 직장의 근로소득 원천징수영수증을 새 회사에 내느냐에 따라 달라집니다.

상황	2027년 2월 새 회사 정산	2027년 5월
① 재취업하지 않음	-	신고하지 않아도 됨(빠진 공제가 있으면 신고해 환급)
② 전 직장 영수증을 내고 합산	19,281원 추가 납부	할 일 없음
③ 영수증을 내지 않고 따로 정산	411,080원 환급	합산 신고로 430,361원 납부

②와 ③은 1년 동안 낸 세금의 합이 같습니다. 따로 정산하면 두 회사가 각자 근로소득공제와 낮은 세율을 적용해 세금을 적게 잡기 때문에, 합산했을 때 생기는 차이를 5월에 한꺼번에 내게 돼요. 두 곳 이상에서 근로소득을 받고 한 곳에서 합산 정산하지 않았다면 다음 해 5월 확정신고 대상입니다.

그래서 이직했다면 전 직장에서 원천징수영수증을 받아 새 회사에 내는 게 가장 간단해요. 홈택스에서도 지급명세서로 조회돼요.

근무한 기간에 쓴 돈만 공제되는 항목

중간에 퇴사하거나 입사한 해에는 공제 항목마다 인정되는 기간이 다릅니다. 국세청은 보험료, 의료비, 교육비 같은 특별세액공제와 신용카드 사용액은 근로를 제공한 기간에 쓴 것만 공제하고, 휴직 기간은 근로 기간에 넣는다고 안내합니다.

인정 기간	항목
근무한 기간 지출분만	보장성 보험료, 의료비, 교육비, 신용카드 등 사용액
그해 전체 지출분	기부금
12월 31일 기준으로 1년 치	본인·부양가족 기본공제(1명 150만 원, 근무 개월 수로 나누지 않음)

예를 들어 퇴사 후 8월에 낸 병원비는 의료비 공제에 넣을 수 없지만, 10월에 낸 기부금은 넣을 수 있어요. 카드 사용액 계산은 신용카드 소득공제, 기부금은 기부금 세액공제에 따로 정리했어요.

5월 종합소득세 신고로 빠진 공제 챙기기

퇴사 후 재취업하지 않았다면 퇴사 달 정산으로 끝내도 되는데, 근로소득만 있는 사람은 연말정산을 했으면 확정신고 의무가 없기 때문이에요. 다만 부모님을 부양가족으로 올리지 못했거나 재직 중 낸 의료비가 빠졌다면, 2027년 5월 1일부터 31일까지 홈택스에서 종합소득세를 신고해 더 돌려받을 수 있습니다.

5월을 놓쳤어도 법정신고기한부터 5년 안에는 경정청구로 바로잡을 수 있습니다. 신고할 때는 전 직장의 원천징수영수증 내용이 홈택스에 이미 들어와 있어서, 빠진 공제만 더하면 돼요.

자주 묻는 질문

1개

Q. 퇴사 후 받은 실업급여나 퇴직금도 총급여에 들어가나요?

둘 다 들어가지 않습니다. 실업급여는 비과세라 연말정산 대상 소득이 아니고, 퇴직금은 퇴직소득으로 따로 세금을 계산해 회사가 지급할 때 떼어 갑니다. 퇴직금 계산은 퇴직금 받는 조건과 계산에서 볼 수 있어요.

연중에 회사를 옮겼다면 연말정산 시즌 전에 전 직장 원천징수영수증부터 챙겨 두세요. 전체 계산 순서는 연말정산 소득공제 세액공제 차이에서 단계별로 확인할 수 있습니다.

참고 자료

공식 출처 6곳

• 국가법령정보센터 — 소득세법 제137조(근로소득세액의 연말정산)·제73조(확정신고 예외)
• 국가법령정보센터 — 소득세법 시행령 [별표 2] 근로소득 간이세액표
• 국세청 — 연말정산 세액계산 방법(중도 퇴직 시 정산 시기)
• 국세상담센터 — 보험료 세액공제 Q&A(근로기간 지출분)
• 국세상담센터 — 기부금 세액공제 Q&A(근로기간 무관)
• 국세청 홈택스 — 지급명세서 조회·종합소득세 신고

※ 2026년 10월 2일 소득세법(2026. 1. 1. 시행)과 간이세액표(2026. 2. 27. 개정) 기준 2026년 귀속 계산입니다. 사례는 본인 1명, 4대보험료 외 공제 자료 미제출, 간이세액표 100% 가정의 근사값이며 실제 금액은 회사 정산 결과에 따라 달라질 수 있습니다.