2026년에 시험관 시술 끝에 첫아이를 낳은 맞벌이 부부를 예로 들어 볼게요. 아내 총급여는 4,000만 원, 남편은 6,000만 원이고, 한 해 동안 난임시술 본인부담금 400만 원, 출산 병원비 100만 원, 산후조리원 300만 원을 냈습니다.
이 돈을 모두 아내 카드로 냈다면 의료비 세액공제는 147만 원, 남편 카드로 냈다면 138만 원입니다.
2026년 10월 13일 기준 · 소득세법 제59조의2·제59조의4 제2항, 소득세법 시행령 제118조의5(2026. 10. 1. 시행판), 같은 법 시행규칙 별지 제43호서식(의료비지급명세서), 국세청 안내 · 2026년 귀속(2027년 1~2월 연말정산) · 세제개편안은 정부안
9만 원 차이는 아내의 의료비 문턱이 낮아서 생기는데, 난임시술비가 600만 원으로 늘면 결론이 뒤집힙니다. 계산을 따라가 보니 아내가 낼 세금보다 공제가 커지는 지점이 있었거든요.
난임시술비 30%, 산후조리원 출산 1회 200만 원
출산을 전후해 나가는 돈은 공제율과 한도가 제각각인데, 2026년 귀속은 2024년부터 적용된 규정이 그대로 이어집니다.
| 비용 | 공제율 | 한도·조건 |
|---|---|---|
| 난임시술비(보조생식술, 관련 처방 의약품 포함) | 30% | 한도 없음, 3% 문턱은 가장 마지막에 차감 |
| 미숙아·선천성이상아 의료비 | 20% | 한도 없음 |
| 산모 본인의 출산 의료비 | 15% | 본인이 내면 한도 없음 |
| 배우자가 대신 낸 출산 의료비 | 15% | 일반 부양가족으로 연 700만 원 한도 |
| 산후조리원 비용 | 15% | 출산 1회당 200만 원, 총급여 요건 없음(2024년 지출분부터) |
| 출산 전 진료비 지원금으로 낸 진료비 | 제외 | 본인이 직접 부담한 돈이 아님 |
같은 출산 병원비라도 아내가 내면 본인 의료비, 남편이 내면 배우자 의료비가 됩니다.
맞벌이 배우자의 의료비는 진료받은 사람이 아니라 실제로 돈을 낸 사람이 공제받기 때문인데, 이 차이가 아래 계산을 가릅니다.
아내가 내면 147만 원, 남편이 내면 138만 원
아내가 모두 냈다면 문턱은 총급여 4,000만 원의 3%인 120만 원입니다. 출산 병원비 100만 원과 산후조리원 인정액 200만 원을 합한 본인 의료비 300만 원에서 문턱을 빼면 180만 원이고, 15%를 곱하면 27만 원이에요.
난임시술비 400만 원은 문턱에 깎이지 않고 30%인 120만 원이 그대로 붙어, 합계 147만 원이 됩니다.
남편이 냈다면 문턱이 180만 원으로 올라갑니다. 아내의 출산 병원비와 산후조리원 300만 원은 일반 부양가족 의료비라 문턱 180만 원을 빼고 남은 120만 원의 15%인 18만 원, 난임시술비는 똑같이 120만 원이에요.
합계 138만 원으로, 아내가 낼 때보다 9만 원 적습니다.
산후조리원은 300만 원을 냈어도 200만 원만 들어간다는 점도 눈여겨보세요. 한도가 출산 1회 기준이라, 한 번 출산하고 조리원을 두 곳 이용했다면 합쳐서 200만 원까지입니다.
난임시술비가 600만 원이면 뒤집힙니다
세액공제는 낼 세금 안에서만 빠집니다. 아내에게 본인 공제와 4대보험료만 있다고 보면 의료비 공제 전 결정세액이 약 156만 원입니다.
난임시술비가 600만 원이면 아내 쪽 공제는 207만 원으로 계산되지만 실제로 줄어드는 세금은 156만 원에서 멈추고, 약 51만 원은 쓰이지 못하고 사라져요.
| 난임시술비 | 아내가 결제 | 남편이 결제 | 유리한 쪽 |
|---|---|---|---|
| 400만 원 | 147만 원 전액 반영 | 138만 원 전액 반영 | 아내 9만 원 |
| 600만 원 | 207만 원 계산, 실제 약 156만 원 | 198만 원 전액 반영 | 남편 약 42만 원 |

그럼 600만 원을 둘이 나눠 내면 어떨까요? 아내가 출산 비용 전부와 난임시술비 430만 원을, 남편이 나머지 난임시술비 170만 원을 냈다고 해 보면 남편 쪽 공제는 0원입니다.
남편에게 다른 의료비가 없어 난임시술비 170만 원이 문턱 180만 원에 모두 깎이기 때문인데, 이 부분은 저희도 계산해 보고 나서야 알았습니다.
나눠 낼 때는 각자 문턱을 넘는지부터 보세요.
간소화 자료에는 난임시술비 구분이 없어요
국세청 간소화 서비스는 병원에 낸 의료비를 보여 주지만 난임시술비와 미숙아 의료비는 따로 구분하지 않습니다. 그대로 두면 일반 의료비처럼 15%로 계산될 수 있어요.
회사에 내는 의료비지급명세서에는 '난임시술비 해당 여부' 칸이 따로 있어서, 난임시술비 금액을 별도 줄로 적고 이 칸에 ○ 표시를 해야 30%가 적용됩니다.
난임 병원에서 시술비 영수증을 받아 금액을 맞춰 보는 것이 확실해요.
산후조리원 비용은 간소화 자료에 나오는 항목이고, 조회되지 않으면 조리원에서 영수증을 받아 회사에 내면 됩니다.
의료비 문턱이 깎이는 전체 순서는 의료비 세액공제에 그림으로 정리해 두었습니다.
아이가 태어난 해에 함께 챙길 공제
아이를 기본공제로 올린 사람은 150만 원 소득공제와 함께 출산 세액공제(첫째 30만 원, 둘째 50만 원, 셋째부터 70만 원)를 받습니다.
난임시술비 600만 원 사례처럼 아내 쪽 세금이 이미 의료비로 바닥났다면 아이까지 아내 쪽에 올려도 줄일 세금이 남아 있지 않으니, 누구에게 올릴지는 맞벌이 연말정산에서 같은 방식으로 따져 보세요.
바뀔 수 있는 내용도 있습니다. 2026년 8월 발표된 세제개편안에는 출산·입양 세액공제를 끝내고 재정 지원으로 돌리는 내용과, 회사가 주는 출산지원금 비과세를 임신 기간 지급분까지 넓히는 내용이 들어 있어요.
둘 다 정부안이라 국회 통과 여부와 적용 시기를 확인한 뒤 이 글에 반영하겠습니다.
자주 묻는 질문
2개
Q. 정부 난임시술 지원을 받은 부분도 공제되나요?
의료비 세액공제는 근로자가 직접 부담한 금액만 대상입니다. 지원금으로 충당된 부분은 빠지고, 내가 병원에 낸 본인부담금과 처방받은 약값이 30% 대상입니다.
Q. 연봉이 1억 원이 넘어도 산후조리원 공제가 되나요?
됩니다. 예전에는 총급여 7,000만 원 이하만 받을 수 있었지만 2024년 1월 1일 이후 지출분부터 이 요건이 없어졌습니다. 다만 총급여가 높으면 3% 문턱도 높아져서, 다른 의료비가 적으면 실제 공제가 작거나 0원일 수 있어요.
2026 연말정산 완전정복
4단계 · 항목별 공제
전체 27개 목차
1단계 · 구조와 일정
2단계 · 12월 31일 전에
3단계 · 가족 공제
4단계 · 항목별 공제
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5단계 · 1월 실전과 환급
참고 자료
공식 출처 5곳
※ 2026년 10월 13일 소득세법·시행령 현행 조문과 국세청 안내 기준(2026년 귀속). 사례는 표 아래 가정으로 계산했으며 실제 공제액은 다른 공제와 결정세액에 따라 달라집니다. 세제개편안 내용은 국회 심의에서 바뀔 수 있습니다.
